現場で使える 理系実務のやさしい基礎講座

Primer-BLASTで特異性の警告が表示されたらどうする？TP53遺伝子の実例を使い、目的外増幅の確認方法、Detailed primer reportsの見方、PCR product sizeを変更して再検索する手順を解説します。

Primer-BLASTの使い方を初心者向けに解説。TP53遺伝子を例に、FASTA配列の入力、PCR産物の長さやTm値の設定、特異性チェック、プライマー設計結果の確認方法まで、実際の画面を使って紹介します。

c.2657+5G>Aの「+5」はどこを表す？CFTRのイントロン変異を例に、c.表記からexon境界を特定し、NCBIでゲノム座標を調べる方法を初心者向けに解説します。

プラス鎖（＋鎖）とマイナス鎖（−鎖）の違いを、NCBI Genome Data Viewerで実際に確認しながら解説します。CFTRとTP53を例に、mRNA上の位置からゲノム座標を計算する方法や、座標計算で「+1」が必要になる場合についても紹介します。

遺伝子変異の周辺配列をNCBIから取得する方法を初心者向けに解説します。TP53のNM_000546.6:c.574C>Tを例に、mRNA座標からゲノム座標を確認し、変異周辺のゲノムDNA配列をFASTA形式で取得するまでを紹介します。

エクソンとイントロンとは何か、NCBI Genome Data Viewerで実際のTP53遺伝子を見ながら初心者向けに解説します。スプライシングやCDS、成熟mRNAとの関係、ゲノムDNAを使ったPCR・プライマー設計でエクソンとイントロンの位置を確認する理由まで紹介します。

遺伝子変異が何番exonにあるのか、NCBIを使って調べる方法を初心者向けに解説します。TP53のNM_000546.6:c.574C>Tを例に、c.表記からmRNA上の位置を確認し、変異を含むexonを特定する手順や、exon 6とcoding exon 5の違いも紹介します。

c.574C>Tは実際の配列のどこ？TP53のRefSeqを例に、NCBIでCDS開始位置を確認し、c.表記から実際の塩基位置を調べる方法を初心者向けに解説します。